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什么是隨機光學重建顯微鏡STORM抚揖?它有什么應用氛琢?

發(fā)布日期: 2022-11-10

隨機光學重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy,簡稱STORM)茅主,是一種超分辨率顯微鏡,其分辨率比傳統(tǒng)光學顯微鏡高10倍以上奕辖。

我們知道获讳,光學顯微鏡憑借其非接觸风钻、無損傷等優(yōu)點,長期以來是生物醫(yī)學研究的重要工具挽放。但由于的衍射限制了光學顯微鏡的分辨率狠寒,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了。本文將從原理质脐、應用等方面對隨機光學重建顯微鏡STORM進行相關(guān)研究伐狼,歡迎各位老師討論交流。


01

光的衍射

限制了光學顯微鏡的分辨率


在了解STORM之前嗜谎,需要先知悉一個概念岁十。眾所周知,光學顯微鏡是用可見光來觀察生物樣品的早知。而光是一種橫波惦踩,當它經(jīng)過一個圓孔,且這個圓孔的大小與光的波長差別不大時杖扫,光在此時不會沿直線傳播押强,而是在各個方向上“溜走”。光在傳播過程中煎喘,遇到障礙物或小孔時溜棉,光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象,這就叫光的衍射卫漫。

由此而形成的圓孔衍射圖樣菲饼,叫“艾里斑”(圖1)。正因如此列赎,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無法把光線在像平面匯聚成無限小的點宏悦,而是只能形成有限大小的艾里斑。如果兩個點很接近包吝,像平面上的兩個艾里斑就幾乎重合在一起饼煞,那物平面上的兩個點就不可分辨了。


圖1、“艾里斑”概念圖


所以砖瞧,光的衍射使得光學顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm)息堂,使得傳統(tǒng)顯微鏡無法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學研究的發(fā)展。


02

超分辨率顯微鏡

打破分辨率極限


科研工作者為了看到更精細的生命體精細結(jié)構(gòu)块促,就要想辦法突破這一成像障礙荣堰。為此,多種超分辨率顯微鏡被開發(fā)了出來(超越了光學顯微鏡的分辨率極限竭翠,故被稱為超分辨顯微鏡)振坚。在這里,我們集中討論其中這樣一個具有相對優(yōu)勢的顯微鏡:隨機光學重建顯微鏡STORM祠劣。

在2006年的Nature上秤淀,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團,從而得到了一種比傳統(tǒng)光學顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù)条焙,并將其命名為隨機光學重建顯微鏡阅六,簡稱STORM。



03

隨機光學重建顯微鏡STORM

技術(shù)原理簡介


正如前面提到的那樣漂熙,兩個挨得很近的光點會讓我們分辨不出誰是誰芒单,那么如果我們分開來看呢?

也就是說袖况,當我們照射并觀察第一個點時抗躺,第二個點并不會發(fā)光,自然不會產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個點抢驴,前者艾里斑的中心點位置就是熒光分子的準確位置蛀篓。接下來,通過某種方法做身,讓第二個點被照亮丸爵。這個時候第一個點又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了,同樣不會干擾對第二個點的觀察汁咏。通過這種“以時間換空間”的設計亚斋,巧妙地繞開了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛,將光學顯微鏡的分辨率大大提高攘滩。

STORM技術(shù)就運用了這種思想帅刊,它使用的是有機熒光分子對染料,并且通過一些方法使細胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光漂问,而不是全部赖瞒。這樣由于發(fā)光的點分布比較分散,重疊比較少蚤假,因此每個光暈可以近似為一個熒光分子栏饮。在一次激發(fā)中吧兔,可以確定一部分光暈的中心,在下一次激發(fā)中袍嬉,可以確定另外一部分光暈的中心掩驱,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加,就是完整而清晰的圖像冬竟。

STROM成像過程包含一系列圖像循環(huán)。每個循環(huán)中鼻昼,只打開視野下一部分熒光基團悟津,這樣每個活躍的熒光集團都被分辨,它們的圖像與其他分子分開吸坐,不重疊宗瓢。這樣確定了基團的準確位置,多次重復這個過程痢抹,每次隨機打開熒光基團的不同亞基旷厨,得到圖像,確定每個亞基的位置后院籍,把以上圖像重建成清晰的整個圖像腋意。理論上STORM可得到分辨率達到幾個納米的熒光圖像。


04

隨機光學重建顯微鏡STORM

技術(shù)應用案例


隨機光學重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù)衡达,能夠在二維或三維往软、多種顏色下成像,甚至可以對活細胞成像郎抖。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容哟蝉、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大,可以應用于生命科學的許多領域茫舶,并為從神經(jīng)科學到亞細胞科學的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像械巡。自STORM技術(shù)被提起以來,越來越多的研究人員認識到了這項技術(shù)的優(yōu)勢并廣泛運用于研究中饶氏。

(以近些年的部分研究成果為例)


2013年讥耗,cell 雜志上的一篇研究報告:莊小威團隊利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對端粒 DNA 進行原位成像,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)嚷往,并系統(tǒng)地評估保護蛋白在 T 環(huán)形成中的作用葛账。(點此查看原文)


圖3、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴散后的 T 環(huán)


2017年皮仁,Liu Riyue團隊開發(fā)了一種光漂白的方法籍琳,以有效地降低藍藻和植物細胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍藻原綠球菌和開花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率。(點此查看原文)



圖片圖4贷祈、雙Z環(huán)的STORM圖像


2018年趋急,Lin, Danying團隊提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法,擴展了多層 3D STORM的成像深度,并顯示了COS-7 細胞中微管呜达、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道姚垂、擴展深度 3D prSTORM圖像。(點此查看原文)



圖5槽脑、 COS-7 細胞中微管障氛、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道、擴展深度 3D prSTORM 圖像


2019煌摊,Schlegel J ,  Peters S ,  Doose S 團隊通過直接隨機光學重建顯微鏡(dSTORM)進行超分辨率顯微鏡觀察衫沽,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集,突出了其對細菌侵襲的重要意義资杆。(點此查看原文)



圖6酒吠、表達GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像

2021,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團隊運用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)课陪,表達IFT融合蛋白的細胞在纖毛基部唇佳,IFT亞基位于九個不同的位點,在它們進入纖毛干之前贱钩,IFT蛋白以高親和力透伺眩靠在纖毛基部的9個位點。(點此查看原文)

色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像


2021琼牧,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團隊運用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)恢筝,表達IFT融合蛋白的細胞在纖毛基部,IFT亞基位于九個不同的位點巨坊,在它們進入纖毛干之前撬槽,IFT蛋白以高親和力停靠在纖毛基部的9個位點趾撵。(點此查看原文)



圖7侄柔、IFT顆粒蛋白的定位,N-或C-末端3HA標記的IFT蛋白占调、KIN1/KIF3A驅(qū)動蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像暂题。


2021,Blandin, Anne-Florence團隊利用球狀體膠質(zhì)瘤細胞擴散的體外模型究珊,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細胞比表達α5的細胞對TKIs更敏感薪者。(點此查看原文)



圖8、吉非替尼處理的細胞的雙色dSTORM圖像顯示細胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復合體


STORM因為其優(yōu)異的單分子成像能力剿涮,越來越多的被用在細胞精細結(jié)構(gòu)的探索言津。對STORM的更多研究將提供更有效的方法來制備樣品和成像樣品,以及提供更高分辨率的圖像取试。相信在未來這項技術(shù)能得到進一步發(fā)展署氏,變成功能更為強大的利器腋殃。





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