隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy辱甫,簡稱STORM)触良,是一種超分辨率顯微鏡海泵,其分辨率比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上闷堡。
我們知道镀梭,光學(xué)顯微鏡憑借其非接觸虹茶、無損傷等優(yōu)點(diǎn)逝薪,長期以來是生物醫(yī)學(xué)研究的重要工具。但由于光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率蝴罪,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學(xué)研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了刷航。本文將從原理、應(yīng)用等方面對隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM進(jìn)行相關(guān)研究驱糜,歡迎各位老師討論交流启尚。
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光的衍射
限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率
在了解STORM之前,需要先知悉一個(gè)概念喧弦。眾所周知内会,光學(xué)顯微鏡是用可見光來觀察生物樣品的淹郎。而光是一種橫波,當(dāng)它經(jīng)過一個(gè)圓孔蝉嘲,且這個(gè)圓孔的大小與光的波長差別不大時(shí)氛硬,光在此時(shí)不會(huì)沿直線傳播,而是在各個(gè)方向上“溜走”痛的。光在傳播過程中田蔑,遇到障礙物或小孔時(shí),光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象梆栏,這就叫光的衍射紫磷。
由此而形成的圓孔衍射圖樣,叫“艾里斑”(圖1)做个。正因如此鸽心,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無法把光線在像平面匯聚成無限小的點(diǎn),而是只能形成有限大小的艾里斑居暖。如果兩個(gè)點(diǎn)很接近顽频,像平面上的兩個(gè)艾里斑就幾乎重合在一起,那物平面上的兩個(gè)點(diǎn)就不可分辨了太闺。
圖1糯景、“艾里斑”概念圖
所以,光的衍射使得光學(xué)顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm)省骂,使得傳統(tǒng)顯微鏡無法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學(xué)研究的發(fā)展蟀淮。
02
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超分辨率顯微鏡
打破分辨率極限
科研工作者為了看到更精細(xì)的生命體精細(xì)結(jié)構(gòu)忍啤,就要想辦法突破這一成像障礙嘁凤。為此,多種超分辨率顯微鏡被開發(fā)了出來(超越了光學(xué)顯微鏡的分辨率極限轮傍,故被稱為超分辨顯微鏡)轧粟。在這里甚疟,我們集中討論其中這樣一個(gè)具有相對優(yōu)勢的顯微鏡:隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM。
在2006年的Nature上梯盹,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復(fù)在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團(tuán),從而得到了一種比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù)欲堪,并將其命名為隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡约绒,簡稱STORM。
03
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隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM
技術(shù)原理簡介
正如前面提到的那樣涯蜜,兩個(gè)挨得很近的光點(diǎn)會(huì)讓我們分辨不出誰是誰痛主,那么如果我們分開來看呢?
也就是說烙锉,當(dāng)我們照射并觀察第一個(gè)點(diǎn)時(shí)蚂芹,第二個(gè)點(diǎn)并不會(huì)發(fā)光谱聂,自然不會(huì)產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個(gè)點(diǎn),前者艾里斑的中心點(diǎn)位置就是熒光分子的準(zhǔn)確位置榨厚。接下來桐装,通過某種方法,讓第二個(gè)點(diǎn)被照亮蒂禽。這個(gè)時(shí)候第一個(gè)點(diǎn)又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了害切,同樣不會(huì)干擾對第二個(gè)點(diǎn)的觀察。通過這種“以時(shí)間換空間”的設(shè)計(jì)逢勾,巧妙地繞開了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛牡整,將光學(xué)顯微鏡的分辨率大大提高。
STORM技術(shù)就運(yùn)用了這種思想溺拱,它使用的是有機(jī)熒光分子對染料逃贝,并且通過一些方法使細(xì)胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光,而不是全部迫摔。這樣由于發(fā)光的點(diǎn)分布比較分散沐扳,重疊比較少,因此每個(gè)光暈可以近似為一個(gè)熒光分子攒菠。在一次激發(fā)中迫皱,可以確定一部分光暈的中心,在下一次激發(fā)中辖众,可以確定另外一部分光暈的中心卓起,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加,就是完整而清晰的圖像凹炸。
STROM成像過程包含一系列圖像循環(huán)戏阅。每個(gè)循環(huán)中,只打開視野下一部分熒光基團(tuán)运诺,這樣每個(gè)活躍的熒光集團(tuán)都被分辨做法,它們的圖像與其他分子分開,不重疊幢垮。這樣確定了基團(tuán)的準(zhǔn)確位置反饲,多次重復(fù)這個(gè)過程,每次隨機(jī)打開熒光基團(tuán)的不同亞基邓刻,得到圖像堵闪,確定每個(gè)亞基的位置后,把以上圖像重建成清晰的整個(gè)圖像锦是。理論上STORM可得到分辨率達(dá)到幾個(gè)納米的熒光圖像涤玷。
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隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM
技術(shù)應(yīng)用案例
隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù),能夠在二維或三維漓琢、多種顏色下成像称几,甚至可以對活細(xì)胞成像捏梯。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大疫稿,可以應(yīng)用于生命科學(xué)的許多領(lǐng)域培他,并為從神經(jīng)科學(xué)到亞細(xì)胞科學(xué)的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像。自STORM技術(shù)被提起以來而克,越來越多的研究人員認(rèn)識(shí)到了這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢并廣泛運(yùn)用于研究中靶壮。
(以近些年的部分研究成果為例)
2013年,cell 雜志上的一篇研究報(bào)告:莊小威團(tuán)隊(duì)利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對端粒 DNA 進(jìn)行原位成像员萍,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)腾降,并系統(tǒng)地評估保護(hù)蛋白在 T 環(huán)形成中的作用。(點(diǎn)此查看原文)
圖3碎绎、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴(kuò)散后的 T 環(huán)
2017年螃壤,Liu Riyue團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種光漂白的方法,以有效地降低藍(lán)藻和植物細(xì)胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍(lán)藻原綠球菌和開花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率筋帖。(點(diǎn)此查看原文)

圖4奸晴、雙Z環(huán)的STORM圖像
2018年,Lin, Danying團(tuán)隊(duì)提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法日麸,擴(kuò)展了多層 3D STORM的成像深度寄啼,并顯示了COS-7 細(xì)胞中微管、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道代箭、擴(kuò)展深度 3D prSTORM圖像诬簇。(點(diǎn)此查看原文)

圖5、 COS-7 細(xì)胞中微管人薯、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道芜既、擴(kuò)展深度 3D prSTORM 圖像
2019,Schlegel J , Peters S , Doose S 團(tuán)隊(duì)通過直接隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(dSTORM)進(jìn)行超分辨率顯微鏡觀察吸辑,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集庵锰,突出了其對細(xì)菌侵襲的重要意義。(點(diǎn)此查看原文)

圖6串飘、表達(dá)GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像
2021陪孩,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn),表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部钳砰,IFT亞基位于九個(gè)不同的位點(diǎn)盅妹,在它們進(jìn)入纖毛干之前,IFT蛋白以高親和力婉迷担靠在纖毛基部的9個(gè)位點(diǎn)。(點(diǎn)此查看原文)
色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像
2021肝浴,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)延都,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部雷猪,IFT亞基位于九個(gè)不同的位點(diǎn),在它們進(jìn)入纖毛干之前晰房,IFT蛋白以高親和力颓笠。靠在纖毛基部的9個(gè)位點(diǎn)。(點(diǎn)此查看原文)

圖7殊者、IFT顆粒蛋白的定位与境,N-或C-末端3HA標(biāo)記的IFT蛋白、KIN1/KIF3A驅(qū)動(dòng)蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像猖吴。
2021摔刁,Blandin, Anne-Florence團(tuán)隊(duì)利用球狀體膠質(zhì)瘤細(xì)胞擴(kuò)散的體外模型,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細(xì)胞比表達(dá)α5的細(xì)胞對TKIs更敏感海蔽。(點(diǎn)此查看原文)

圖8共屈、吉非替尼處理的細(xì)胞的雙色dSTORM圖像顯示細(xì)胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復(fù)合體
STORM因?yàn)槠鋬?yōu)異的單分子成像能力,越來越多的被用在細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu)的探索党窜。對STORM的更多研究將提供更有效的方法來制備樣品和成像樣品拗引,以及提供更高分辨率的圖像。相信在未來這項(xiàng)技術(shù)能得到進(jìn)一步發(fā)展茧淮,變成功能更為強(qiáng)大的利器椿烂。