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什么是隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM幔戏?它有什么應(yīng)用捷犹?

發(fā)布日期: 2022-11-10

隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy,簡稱STORM)而晒,是一種超分辨率顯微鏡,其分辨率比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上廷前。

我們知道夜只,光學(xué)顯微鏡憑借其非接觸、無損傷等優(yōu)點(diǎn)镰吵,長期以來是生物醫(yī)學(xué)研究的重要工具。但由于的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率捉瘟,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學(xué)研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了旁班。本文將從原理蔑誓、應(yīng)用等方面對隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM進(jìn)行相關(guān)研究,歡迎各位老師討論交流职菜。


01

光的衍射

限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率


在了解STORM之前誉梳,需要先知悉一個概念。眾所周知兰险,光學(xué)顯微鏡是用可見光來觀察生物樣品的骇俏。而光是一種橫波,當(dāng)它經(jīng)過一個圓孔脚培,且這個圓孔的大小與光的波長差別不大時北郁,光在此時不會沿直線傳播,而是在各個方向上“溜走”纺围。光在傳播過程中用劲,遇到障礙物或小孔時,光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象僧旬,這就叫光的衍射炉奴。

由此而形成的圓孔衍射圖樣,叫“艾里斑”(圖1)蛇更。正因如此盆佣,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無法把光線在像平面匯聚成無限小的點(diǎn),而是只能形成有限大小的艾里斑械荷。如果兩個點(diǎn)很接近,像平面上的兩個艾里斑就幾乎重合在一起虑灰,那物平面上的兩個點(diǎn)就不可分辨了吨瞎。


圖1、“艾里斑”概念圖


所以穆咐,光的衍射使得光學(xué)顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm)颤诀,使得傳統(tǒng)顯微鏡無法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學(xué)研究的發(fā)展。


02

超分辨率顯微鏡

打破分辨率極限


科研工作者為了看到更精細(xì)的生命體精細(xì)結(jié)構(gòu)对湃,就要想辦法突破這一成像障礙崖叫。為此,多種超分辨率顯微鏡被開發(fā)了出來(超越了光學(xué)顯微鏡的分辨率極限拍柒,故被稱為超分辨顯微鏡)心傀。在這里,我們集中討論其中這樣一個具有相對優(yōu)勢的顯微鏡:隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM柔朽。

在2006年的Nature上垂暖,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復(fù)在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團(tuán),從而得到了一種比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù)精杜,并將其命名為隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡穗阐,簡稱STORM涉泡。



03

隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM

技術(shù)原理簡介


正如前面提到的那樣,兩個挨得很近的光點(diǎn)會讓我們分辨不出誰是誰能莫,那么如果我們分開來看呢政茄?

也就是說,當(dāng)我們照射并觀察第一個點(diǎn)時妇愉,第二個點(diǎn)并不會發(fā)光彭闷,自然不會產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個點(diǎn),前者艾里斑的中心點(diǎn)位置就是熒光分子的準(zhǔn)確位置屎谆。接下來拨聚,通過某種方法,讓第二個點(diǎn)被照亮琐览。這個時候第一個點(diǎn)又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了丑瞧,同樣不會干擾對第二個點(diǎn)的觀察。通過這種“以時間換空間”的設(shè)計(jì)蜀肘,巧妙地繞開了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛绊汹,將光學(xué)顯微鏡的分辨率大大提高。

STORM技術(shù)就運(yùn)用了這種思想扮宠,它使用的是有機(jī)熒光分子對染料西乖,并且通過一些方法使細(xì)胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光,而不是全部坛增。這樣由于發(fā)光的點(diǎn)分布比較分散获雕,重疊比較少,因此每個光暈可以近似為一個熒光分子收捣。在一次激發(fā)中届案,可以確定一部分光暈的中心,在下一次激發(fā)中罢艾,可以確定另外一部分光暈的中心楣颠,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加,就是完整而清晰的圖像咐蚯。

STROM成像過程包含一系列圖像循環(huán)拯拓。每個循環(huán)中,只打開視野下一部分熒光基團(tuán)须涣,這樣每個活躍的熒光集團(tuán)都被分辨涌咪,它們的圖像與其他分子分開,不重疊盐腻。這樣確定了基團(tuán)的準(zhǔn)確位置下风,多次重復(fù)這個過程,每次隨機(jī)打開熒光基團(tuán)的不同亞基嘁汗,得到圖像鹤肥,確定每個亞基的位置后永音,把以上圖像重建成清晰的整個圖像。理論上STORM可得到分辨率達(dá)到幾個納米的熒光圖像冠樱。


04

隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM

技術(shù)應(yīng)用案例


隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù)炭箭,能夠在二維或三維、多種顏色下成像颠舞,甚至可以對活細(xì)胞成像菌司。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大粤铭,可以應(yīng)用于生命科學(xué)的許多領(lǐng)域挖胃,并為從神經(jīng)科學(xué)到亞細(xì)胞科學(xué)的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像。自STORM技術(shù)被提起以來梆惯,越來越多的研究人員認(rèn)識到了這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢并廣泛運(yùn)用于研究中酱鸭。

(以近些年的部分研究成果為例)


2013年,cell 雜志上的一篇研究報(bào)告:莊小威團(tuán)隊(duì)利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對端粒 DNA 進(jìn)行原位成像垛吗,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)凹髓,并系統(tǒng)地評估保護(hù)蛋白在 T 環(huán)形成中的作用。(點(diǎn)此查看原文)


圖3怯屉、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴(kuò)散后的 T 環(huán)


2017年蔚舀,Liu Riyue團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種光漂白的方法,以有效地降低藍(lán)藻和植物細(xì)胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍(lán)藻原綠球菌和開花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率锨络。(點(diǎn)此查看原文)



圖片圖4赌躺、雙Z環(huán)的STORM圖像


2018年,Lin, Danying團(tuán)隊(duì)提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法羡儿,擴(kuò)展了多層 3D STORM的成像深度寿谴,并顯示了COS-7 細(xì)胞中微管、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道搜痕、擴(kuò)展深度 3D prSTORM圖像。(點(diǎn)此查看原文)



圖5队趁、 COS-7 細(xì)胞中微管绍撇、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道、擴(kuò)展深度 3D prSTORM 圖像


2019松摘,Schlegel J ,  Peters S ,  Doose S 團(tuán)隊(duì)通過直接隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(dSTORM)進(jìn)行超分辨率顯微鏡觀察督垮,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集,突出了其對細(xì)菌侵襲的重要意義乳栈。(點(diǎn)此查看原文)



圖6影啸、表達(dá)GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像

2021,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)组伤,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部羡财,IFT亞基位于九個不同的位點(diǎn)监镰,在它們進(jìn)入纖毛干之前,IFT蛋白以高親和力头セ常靠在纖毛基部的9個位點(diǎn)俐芬。(點(diǎn)此查看原文)

色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像


2021,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)细溅,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部褥傍,IFT亞基位于九個不同的位點(diǎn),在它們進(jìn)入纖毛干之前喇聊,IFT蛋白以高親和力突蟹纾靠在纖毛基部的9個位點(diǎn)。(點(diǎn)此查看原文)



圖7誓篱、IFT顆粒蛋白的定位朋贬,N-或C-末端3HA標(biāo)記的IFT蛋白、KIN1/KIF3A驅(qū)動蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像燕鸽。


2021兄世,Blandin, Anne-Florence團(tuán)隊(duì)利用球狀體膠質(zhì)瘤細(xì)胞擴(kuò)散的體外模型,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細(xì)胞比表達(dá)α5的細(xì)胞對TKIs更敏感啊研。(點(diǎn)此查看原文)



圖8御滩、吉非替尼處理的細(xì)胞的雙色dSTORM圖像顯示細(xì)胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復(fù)合體


STORM因?yàn)槠鋬?yōu)異的單分子成像能力,越來越多的被用在細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu)的探索党远。對STORM的更多研究將提供更有效的方法來制備樣品和成像樣品削解,以及提供更高分辨率的圖像。相信在未來這項(xiàng)技術(shù)能得到進(jìn)一步發(fā)展蒸败,變成功能更為強(qiáng)大的利器圾恐。





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