近期霜铸,匹茲堡大學(xué)Yang Liu教授團(tuán)隊在病人組織染色質(zhì)結(jié)構(gòu)超高分辨率顯微成像方面取得了重要進(jìn)展帖鸦,團(tuán)隊設(shè)計了可直接用于病人組織DNA結(jié)構(gòu)超分辨成像的小分子探針,運用隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)實現(xiàn)了對病人組織染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的簡單痒池、可靠并且快速的高分辨率成像缚庐,對于研究染色質(zhì)結(jié)構(gòu)在癌變過程中的作用有著重大意義绵患。相關(guān)成果發(fā)表在權(quán)威期刊Science Advances辣摘,徐建全博士為文章第一作者帮廉。
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研究介紹(節(jié)選)
眾所周知徽榄,在微觀尺度上,細(xì)胞核或者染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的變化是癌細(xì)胞最典型的特征之一闲耿,也是病理學(xué)家在光學(xué)顯微鏡下用來檢測癌癥或確定其表型的重要依據(jù)胰薪。然而目前的研究還尚不清楚癌變過程中染色質(zhì)在分子尺度上的變化情況。
由于分辨率的限制及光學(xué)衍射極限的存在减组,傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡無法觀測到分子級別上染色質(zhì)的變化蓄士。近年來高速發(fā)展的超分辨熒光顯微鏡技術(shù)打破了傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡對分辨率的限制,將分辨率提高到幾十甚至幾納米哆卓,極大擴(kuò)展了研究人員在細(xì)胞和亞細(xì)胞水平上研究生物分子以及生物過程的能力肋漏。
在各種超分辨率顯微技術(shù)中,隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡 (STORM) 工作原理相對簡單岂苏,利用熒光分子的光轉(zhuǎn)換特性沽叠,可以獲得優(yōu)越的空間分辨率,因此得到了非常廣泛的應(yīng)用报斗。把這項技術(shù)應(yīng)用于觀測癌變過程中細(xì)胞核的微觀結(jié)構(gòu)變化菊榨,從而研究癌癥的發(fā)病機(jī)制,并提供更加準(zhǔn)確的癌癥檢測標(biāo)準(zhǔn)夫啊,具有重要意義函卒。
福爾馬林固定石蠟包埋組織(FFPE)是醫(yī)學(xué)上最常用的標(biāo)本,而目前常規(guī)應(yīng)用于STORM成像的熒光分子無法用于石蠟包埋組織中染色質(zhì)的超分辨成像撇眯,或者無法達(dá)到很高的分辨率报嵌,這極大影響了該技術(shù)在這一領(lǐng)域的應(yīng)用。
匹茲堡大學(xué)Liu Yang研究團(tuán)隊將光轉(zhuǎn)換性質(zhì)優(yōu)越的Cyanine-5分子與DNA染色劑Hoechst耦聯(lián)(Hoechst-Cy5)熊榛,可實現(xiàn)對FFPE組織中DNA的快速染色锚国,并利用Cyanine-5的光轉(zhuǎn)換性質(zhì)進(jìn)行高分辨率的STORM成像腕巡,從而實現(xiàn)對FFPE組織細(xì)胞中染色質(zhì)超微結(jié)構(gòu)的可視化,并成功將此技術(shù)用于病人樣本的檢測血筑。

通過對多組病人FFPE樣本的細(xì)胞核內(nèi)DNA的STORM超分辨成像绘沉,他們發(fā)現(xiàn)細(xì)胞在癌變過程中核內(nèi)染色質(zhì)會變得更加松散,核小體團(tuán)簇(nucleosome clusters)尺寸變小豺总。而這種染色質(zhì)更為松散的結(jié)構(gòu)與細(xì)胞的多項功能息息相關(guān)车伞,例如細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄過程與核纖層的結(jié)構(gòu)變化等。
研究人員利用雙色STORM成像發(fā)現(xiàn)喻喳,癌癥細(xì)胞中更松散的染色質(zhì)促進(jìn)了細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄活性关读,表現(xiàn)為RNA聚合酶(RNAPII)團(tuán)簇的尺寸增大,并且與松散結(jié)構(gòu)的染色質(zhì)共定位程度增加巍坦。此外够戒,癌變過程中,核膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著變化腿若,核膜處的染色質(zhì)松散程度更為顯著驼牵,并且核核纖層結(jié)構(gòu)遭到破壞。這種變化可能與Lamina-associated domains (LADs) 在癌變過程中的功能有關(guān)盈侣。

研究人員進(jìn)一步將此技術(shù)用于檢測林奇綜合癥(Lynch)的病人組織標(biāo)本腌哎。實驗結(jié)果表明貌梦,與健康人相比瘩穆,患有林奇綜合癥的病人細(xì)胞具有更加松散的染色質(zhì)結(jié)構(gòu),這可能預(yù)示著更高的患癌風(fēng)險尸饵。這項發(fā)現(xiàn)可能對于癌癥的風(fēng)險評估與早期診斷有著重大的意義自驹。