“ 單粒子追蹤(single-particle tracking读拆,SPT)是對介質(zhì)內(nèi)單個粒子運動的觀察。坐標時間序列,可以是二維(x , y)或三維(x , y , z),被稱為軌跡锄奢。通常使用統(tǒng)計方法分析軌跡描刹,以提取有關(guān)粒子潛在動力學的信息弹谁。這些動力學可以揭示所觀察到的傳輸類型(例如茸塞,熱傳輸或活動傳輸)、粒子移動的介質(zhì)以及與其他粒子的相互作用的信息描沟。在隨機運動的情況下飒泻,可以使用軌跡分析來測量擴散系數(shù)。”
顯微技術(shù)允許使用光漂白后熒光恢復(fluorescence recovery after photobleaching吏廉,F(xiàn)RAP)或單粒子或量子點跟蹤的單蛋白質(zhì)遷移率表征蛋白質(zhì)的全局遷移率分析泞遗。例如惰许,全內(nèi)反射熒光顯微鏡允許擬南芥質(zhì)膜蛋白的 SPT,揭示它們的異質(zhì)分布史辙、低橫向擴散和響應鹽脅迫的動態(tài)特性胜玖。然而,基于綠色熒光蛋白的 SPT 研究受到表面蛋白質(zhì)密度的限制鹏愚,因為衍射發(fā)射熒光會阻止跟蹤距離小于 1 μm 的單個蛋白質(zhì)竿疫。而基于時間發(fā)射去相關(guān)的高密度 SPT 技術(shù),例如使用光激活定位顯微鏡(single-particle tracking with photoactivated localization microscopy味羡,sptPALM)進行單粒子跟蹤军笑,打破了經(jīng)典光學顯微鏡的衍射極限并達到納米級空間分辨率,使得以~20-80 nm 的精度表征質(zhì)膜蛋白的結(jié)構(gòu)和動態(tài)異質(zhì)性成為可能见拴。在這項研究中,研究者報告了活細胞 sptPALM 技術(shù)在植物中的首次使用贫迫,提供了單個膜蛋白運動的高密度超分辨率納米級圖像馒毙。
《Super-Resolved and Dynamic Imaging of Membrane Proteins in Plant Cells Reveal Contrasting Kinetic Profiles and Multiple Confinement Mechanisms》
01研究結(jié)果
1、超高分辨率動態(tài)成像
首先手欣,研究者在轉(zhuǎn)基因擬南芥中表達了可用于光活化的mEOS2融合蛋白疫壕,并在使用斜向照明后進行了單蛋白追蹤。而后從眾多稀疏的mEOS2融合蛋白中構(gòu)建了超分辨率圖像癞樊,在 5 分鐘的實驗記錄期間秸谢,在 ~900平方微米的細胞區(qū)域上檢測到了 >100,000 個單體熒光點。這組數(shù)據(jù)分別提供了二維空間密度圖和 mEOS2 融合蛋白與兩個質(zhì)膜標記物 AtPIP2;1(質(zhì)膜內(nèi)在蛋白)和 LTi6a(低溫誘導蛋白)以及液泡膜標記物 AtTIP1;1(液泡膜內(nèi)在蛋白)的相應軌跡霹肝。
圖1. sptPALM 成像
AtPIP2;1-mEOS2 顯示出異質(zhì)和稀疏的定位估蹄,密度相對較低(1.12 個分子每平方微米)(圖 1A,左圖)沫换。重建的軌跡反映了高限制行為(圖 1A臭蚁,中圖和右圖)。LTi6a-mEOS2 的超分辨率圖表現(xiàn)出更均勻的分布(圖 1B讯赏,左圖)垮兑,軌跡圖顯示具有更高的移動性(圖 1B,中圖和右圖)漱挎。AtTIP1;1-mEOS2 的遷移率也被記錄下來系枪,證明了 sptPALM 對細胞內(nèi)膜蛋白的適用性。超分辨率圖像表明 AtTIP1;1-mEOS2 的移動性非晨牧拢快私爷,導致均勻的重新分配(圖 1C)。
2怜庸、膜蛋白動態(tài)軌跡特征
證實細胞間運動行為變異性很弱且可重復后咸婿,對于持續(xù)160 毫秒(≥8 幀)以上的軌跡姚转,研究者計算了均方位移 (mean square displacement,MSD)棒嚼,以描述分子的擴散特性们敢,并通過線性回歸擬合提取瞬時擴散系數(shù) D 。這些遷移率值的對數(shù)呈現(xiàn)鐘形分布啃掠。通過正態(tài)分布擬合 D 慷训,提取每個細胞的峰值。在表達 AtPIP2;1-mEOS2 的細胞中觀察到的低 D 值表明該蛋白質(zhì)基本上是固定的键梆。然而蝉橘,在表達這種融合蛋白的一些細胞中,可以清楚地觀察到 D 值的雙鐘形分布畦未,表明存在少量可移動的蛋白分子润邑。相比之下,LTi6a-mEOS2 和 AtTIP1保铐;1-mEOS2 的擴散行為更強哄谆。
圖2. 運動軌跡相關(guān)指標
這些結(jié)果指向了植物膜蛋白的對比動力學特征。運動性最低的 AtPIP2;1-mEOS2 的移動性比其哺乳動物同源物 AQP1 低7到19倍季春,揭示植物特有的行為洗搂;植物細胞質(zhì)膜中的脂質(zhì)的擴散系數(shù)與 LTi6a 的擴散系數(shù)處于同一數(shù)量級;最后载弄,發(fā)現(xiàn) AtTIP1;1-mEOS2 的平面遷移率略高于哺乳動物細胞膜蛋白耘拇,這代表了膜蛋白記錄的最快運動之一,與從桉樹細胞中純化的液泡膜中的脂質(zhì)處于同一數(shù)量級宇攻。進一步研究表明肌動蛋白部分與 AtPIP2;1-mEOS2 的運動限制有關(guān)惫叛,但主要原因是細胞壁通過內(nèi)部膨脹壓力與質(zhì)膜緊密結(jié)合,導致膜蛋白的橫向擴散受阻逞刷。
02研究總結(jié)
- sptPALM 技術(shù)可在植物細胞膜蛋白中應用挣棕;
- 不同膜蛋白分子的運動特征差別較大,與同源物也有較大差別亲桥;
- AtPIP2;1的運動限制主要來源于細胞壁洛心。
在本研究中,研究者主要借助 sptPALM 來破譯植物活細胞中液泡膜和質(zhì)膜蛋白的動態(tài)組織题篷。 PALM 與STORM原理相似词身,STORM同樣可用于SPT,且具有更高的分辨率木砾。這項2014年諾貝爾化學獎的發(fā)現(xiàn)已在國內(nèi)實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化农灯。 寧波 力顯智能科技 有限公司 (INVIEW) 現(xiàn)已發(fā)布超高分辨率顯微系統(tǒng) iSTORM ,采用3D隨機光學重構(gòu)技術(shù)瘸劳、高精度細胞實時鎖定技術(shù)品扯、多通道同時成像技術(shù)等投沃,以 納米級觀測精度 、 高穩(wěn)定性 捻钢、 廣泛環(huán)境適用 绞艘、 快速成像 、 簡易操作 等優(yōu)異特性稻续,獲得了超過50家科研小組和100多位科研人員的高度認可妈削。
參考文獻:
1. Super-Resolved and Dynamic Imaging of Membrane Proteins in Plant Cells Reveal Contrasting Kinetic Profiles and Multiple Confinement Mechanisms
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