什么是隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM?
它有什么應(yīng)用酝豪?
高爾基體轉(zhuǎn)運(yùn)網(wǎng)絡(luò)(TGN)和核內(nèi)體是分泌轉(zhuǎn)運(yùn)途徑中重要的蛋白質(zhì)分選站晨每。蛋白質(zhì)分選基本上是一個(gè)空間分離的過程,但在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中,尚未以高分辨率系統(tǒng)地分析構(gòu)成分選機(jī)制的蛋白質(zhì)之間的空間關(guān)系瓮钥。在這里遵非,作者借助STORM成像菌熬,表明TGN/內(nèi)涵體定位的貨物銜接子AP-1英鸵,GGA2和epsinR,在近核高爾基體區(qū)域形成長度超過250納米的伸長結(jié)構(gòu)怠写。作者的數(shù)據(jù)表明酿边,TGN/內(nèi)涵體定位的貨物銜接子具有明顯的空間關(guān)系【苟鳎空間分離的貨物銜接子GGA2和AP-1分別調(diào)節(jié)Frizzled6和Vangl2的分選恶恨,并且空間相關(guān)的貨物銜接子可以協(xié)同調(diào)節(jié)特定的分選過程。
NO.1研究介紹(節(jié)選)
在這里伸坑,作者利用隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)以高分辨率提供參與TGN/內(nèi)體分選過程的蛋白質(zhì)空間分布的更廣泛視圖痴猖。STORM成像在同一照相機(jī)幀中同時(shí)捕獲兩種熒光染料以實(shí)現(xiàn)20nm的空間分辨率。作者揭示了貨物銜接子AP-1和GGA2是空間分離的念脯,它們分別介導(dǎo)平面細(xì)胞極性蛋白Vangl2和Frizzled6的分選狞洋。超分辨率成像研究顯示Frizzled6和Vangl2在空間上與不同的網(wǎng)格蛋白銜接子相關(guān),提供了差異貨物分選過程的直接觀察绿店。
NO.2研究結(jié)果(節(jié)選)
1.網(wǎng)格蛋白與TGN/內(nèi)體定位的貨物銜接子的空間關(guān)系分析
為了測試STORM是否可以用于比較不同高爾基體定位蛋白之間的空間關(guān)系吉懊,作者分析了順式高爾基體標(biāo)記GM 130和反式高爾基體標(biāo)記Golgin-97的定位模式。使用常規(guī)光學(xué)顯微鏡假勿,GM 130的定位模式與Golgin 97的定位模式?jīng)]有明顯區(qū)別(圖1A),相反借嗽,用STORM,作者觀察到GM 130與Golgin-97的明顯分離(圖1B转培,C)恶导。因此,STORM是揭示不同高爾基體定位蛋白質(zhì)之間空間關(guān)系的可行工具浸须。
(A惨寿,B)通過常規(guī)熒光顯微鏡(A)或通過STORM(B)可視化的相同COS7細(xì)胞中的順式高爾基體標(biāo)記(GM130)和反式高爾基體標(biāo)記(高爾基體-97)的定位模式。比例尺羽戒,500 nm缤沦。(C)(B)中所示區(qū)域的放大圖。比例尺巷况,100 nm赎冶。(D)STORM技術(shù)揭示了兩種不同熒光染料標(biāo)記的順式高爾基體標(biāo)記物(GM130)在COS7細(xì)胞中的定位模式。比例尺诵捏,500 nm幌舍。(E)(D)中所示區(qū)域的放大圖。比例尺罕鞭,100 nm屋孕。(F)基于從每個(gè)實(shí)驗(yàn)組中的一個(gè)實(shí)驗(yàn)獲得的四個(gè)超分辨率圖像咖播,量化GM130和Golgin-97之間以及Alexa Fluor 750標(biāo)記的GM130和Alexa Fluor 647標(biāo)記的GM130之間的重疊像素百分比(平均值± SD)。* ** p〈0.001硕纯,采用雙尾Student t檢驗(yàn)铣佛。超分辨率圖像顯示了所指示蛋白在整個(gè)核旁區(qū)域中的定位模式。圖中的每個(gè)點(diǎn)代表每個(gè)單個(gè)細(xì)胞的整個(gè)近核高爾基區(qū)的數(shù)據(jù)握帘。
使用STORM袜晌,作者試圖分析COS7細(xì)胞中網(wǎng)格蛋白和貨物銜接子之間的空間關(guān)系。作者選擇了大部分貨物銜接子位于其中的整個(gè)近核高爾基區(qū)用于以下超分辨率成像分析篱俊。這一分析表明但惶,STORM可以檢測到網(wǎng)格蛋白在囊泡外殼周圍的環(huán)狀定位。
圖2 近核區(qū)貨物銜接子與網(wǎng)格蛋白的空間關(guān)系分析
(A-G用抗網(wǎng)格蛋白重鏈和γ 1-adaptin的抗體共染色COS7細(xì)胞湿蛔。應(yīng)用STORM技術(shù)分析了γ 1-adaptin標(biāo)記的AP-1和網(wǎng)格蛋白重鏈標(biāo)記的網(wǎng)格蛋白在COS7細(xì)胞中的二維(A-C)和三維(D-G ")定位模式膀曾。(A,D)中指示區(qū)域的放大圖分別顯示在(B阳啥,C)和(E-G ")中添谊。(H-K').用epsinR-FLAG轉(zhuǎn)染COS7細(xì)胞。轉(zhuǎn)染后第1天苫纤,細(xì)胞用抗γ 1-adaptin抗體和FLAG標(biāo)簽共染色碉钠。STORM分析同一COS7細(xì)胞中epsinR-FLAG和網(wǎng)格蛋白重鏈的空間定位模式。(H)中指定區(qū)域的放大圖見(I-K ")卷拘。(L-O用抗網(wǎng)格蛋白重鏈和GGA2的抗體共染色COS7細(xì)胞喊废。STORM技術(shù)分析GGA2和網(wǎng)格蛋白重鏈在同一COS7細(xì)胞中的三維定位模式。(L)中指定區(qū)域的放大圖見(M-O ")栗弟。(P-R)COS7細(xì)胞與抗網(wǎng)格蛋白重鏈和AP3 δ 1的抗體共染色污筷。應(yīng)用STORM分析AP3 δ 1和網(wǎng)格蛋白重鏈標(biāo)記的AP-3在COS7細(xì)胞中的二維定位模式。圖P中所示區(qū)域的放大圖顯示在(Q乍赫,R)中瓣蛀。(S)基于每個(gè)實(shí)驗(yàn)組3次獨(dú)立重復(fù)采集的超分辨率圖像,定量與網(wǎng)格蛋白相關(guān)的AP-1杭恩、GGA2踢周、AP-3或epsinR斑點(diǎn)組分(平均值± SD,基于≥ 9張超分辨率圖像)悠拗。超分辨率圖像顯示了所指示蛋白質(zhì)在整個(gè)近核區(qū)域中的定位模式黎撤,其中定位了大多數(shù)貨物銜接子。圖中的每個(gè)點(diǎn)代表每個(gè)單個(gè)細(xì)胞的整個(gè)近核高爾基區(qū)的數(shù)據(jù)尘是。
2.TGN/核內(nèi)體定位的貨物銜接子空間關(guān)系分析
接下來侄灭,作者以精細(xì)分辨率分析了TGN和內(nèi)體定位的貨物銜接子之間的空間關(guān)系。
AP-1和epsinR的超分辨率成像分析顯示一些epsinR結(jié)構(gòu)與AP-1結(jié)構(gòu)相關(guān)(圖3E-H,和圖3I中的定量)和一些AP-1和epsinR結(jié)構(gòu)彼此分離(圖3E亏傅,G)摊谢。
圖3 近核區(qū)網(wǎng)格蛋白銜接子的空間關(guān)系分析
(A-D,N-Q)COS 7細(xì)胞與γ1-adaptin和δ3-adaptin抗體共染色或與γ1-adaptin和GGA 2抗體共染色醉装。然后使用STORM來可視化AP-1和AP-3的定位(A-D)以及AP-1和GGA 2的定位(N-Q)辕芳。(E-H,J-M)宵睦。用epsinR-FLAG轉(zhuǎn)染COS 7細(xì)胞性宏。轉(zhuǎn)染后第1天,用抗γ1-適應(yīng)素和FLAG標(biāo)簽的抗體(E-H)或抗GGA 2和FLAG標(biāo)簽的抗體(J-M)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行共染色状飞。然后使用STORM可視化γ1和epsinR-FLAG的定位以及GGA 2和epsinR-FLAG的定位。(A书斜、E诬辈、J、N)中指定區(qū)域的放大視圖如(B-D荐吉、F-H焙糟、K-M、O-Q)所示样屠。顯示了每個(gè)面板的比例尺穿撮。(I,R)定量與epsinR或AP-3相關(guān)的AP-1斑點(diǎn)百分比(I)痪欲,定量與epsinR或AP-1相關(guān)的GGA 2斑點(diǎn)百分比(R)(平均值± SD悦穿,基于≥7張超分辨率圖像)。***p〈0.001业踢,采用雙尾Student t檢驗(yàn)落怀。AP-1和AP-3分別用抗γ1和δ3抗體標(biāo)記。超分辨率圖像顯示了所指示蛋白質(zhì)在整個(gè)近核區(qū)域中的定位模式种洛,其中定位了大多數(shù)貨物銜接子百览。圖中的每個(gè)點(diǎn)代表每個(gè)單個(gè)細(xì)胞的整個(gè)近核高爾基區(qū)的數(shù)據(jù)。定量分析基于從每個(gè)實(shí)驗(yàn)組的三次獨(dú)立重復(fù)獲得的超分辨率圖像拔泪。
3.通過超分辨率成像分析可視化平面細(xì)胞極性蛋白Vangl2和Frizzled6在TGN離開時(shí)的分選
作者選擇了大部分Vangl2定位的近核區(qū)域用于超分辨率成像分析笑杯。STORM成像分析顯示,大多數(shù)Vangl2 Y279A谍臀、Y280A點(diǎn)狀結(jié)構(gòu)不與AP-1相鄰(圖4J辱得、U)。接下來作者試圖用STORM觀察這些分選過程盼靠。
圖4 Vangl2和Frizzled6在通過STORM退出TGN時(shí)的分類可視化
(A-H用HA-Vangl2(wt)轉(zhuǎn)染COS7細(xì)胞擂冷。轉(zhuǎn)染后第1天,將細(xì)胞在20 ℃下孵育2 h,然后在32 ℃下孵育5 min砂裹。孵育后贬池,用STORM觀察Vangl2(wt)和AP-1 γ亞基在二維(A-D)和三維(E-H ")的定位。(A)中指示區(qū)域的放大圖見(B-D)文黎。(E)中指示區(qū)域的放大圖見(F-H)惹苗。(F-H)的180 °旋轉(zhuǎn)視圖如(F'- H')所示。顯示了每張圖像的比例尺耸峭。(I-K)用HA-Vangl2(wt)或HA-Vangl2 Y279A桩蓉、Y280A或HA-Frizzled6轉(zhuǎn)染COS7細(xì)胞。轉(zhuǎn)染后第1天劳闹,將細(xì)胞在20 ℃下孵育2 h院究,然后在32 ℃下孵育5 min。孵育后本涕,用STORM觀察Vangl2(wt)和AP-3 δ亞基(I)业汰,Vangl2 Y279A、Y280A和AP-1 γ亞基(J)菩颖,F(xiàn)rizzled6和AP-1 γ亞基(K)的定位样漆。比例尺,500 nm晦闰。(L-Q)COS7細(xì)胞用HA-Vangl2(L)或HA-Frizzled6(M-P)轉(zhuǎn)染或用epsinR-FLAG和HA-Frizzled6(Q-T)共轉(zhuǎn)染放祟。轉(zhuǎn)染后第1天,將細(xì)胞在20 ℃下孵育2 h散烂,然后在32 ℃下孵育5 min巾妖。溫育后,使用雙色STORM來顯現(xiàn)Vangl2和GGA2(L)变钙、Frizzled6和GGA2(M-P)或epsinR-FLAG和Frizzled6(Q)的定位衙地。(M,Q)中指示區(qū)域的放大圖如(N-P啸业,R-T)所示洗筛。(U)與指定貨物相關(guān)的Vangl2或Frizzled6斑點(diǎn)百分比的定量|適配器(平均值± SD,基于每個(gè)實(shí)驗(yàn)組≥ 6張超分辨率圖像)宿柜。* * p〈0.01凸窖,*** p〈0.001,采用雙尾Student t檢驗(yàn)霹补。超分辨率圖像顯示了所指示蛋白質(zhì)在整個(gè)近核區(qū)域中的定位模式天证,其中定位了大多數(shù)貨物銜接子。圖中的每個(gè)點(diǎn)代表每個(gè)單個(gè)細(xì)胞的整個(gè)近核高爾基區(qū)的數(shù)據(jù)十匆。定量分析基于從每個(gè)實(shí)驗(yàn)組的三次獨(dú)立重復(fù)獲得的超分辨率圖像哀买。(V)所提出的模型顯示AP-1顷锰、AP-3、epsinR和GGA2在TGN和內(nèi)體膜上的不同微結(jié)構(gòu)域上組裝成具有不同空間關(guān)系的伸長結(jié)構(gòu):空間分離的GGA2和AP-1分別調(diào)控Frizzled6和Vangl2的分選;空間相關(guān)的貨物銜接子GGA2和epsinR共同調(diào)節(jié)Frizzled6的分選亡问。
NO.3研究討論(節(jié)選)
STORM超高分辨率成像分析也揭示了AP1結(jié)構(gòu)與GGA2結(jié)構(gòu)在很大程度上是分離的官紫,并且至少存在兩個(gè)epsinR群,一個(gè)與AP-1相關(guān)州藕,另一個(gè)與GGA2相關(guān)(圖4V).在酵母中束世,這些觀察結(jié)果表明,從酵母到哺乳動(dòng)物細(xì)胞床玻,貨物銜接子之間的空間關(guān)系是保守的毁涉。
總之,STORM超高分辨率成像分析表明锈死,貨物銜接子AP-1贫堰、AP-3和GGA 2在TGN或核內(nèi)體的不同出口結(jié)構(gòu)域組裝成大的細(xì)長結(jié)構(gòu),以介導(dǎo)特定貨物分子的分選(圖4V)待牵⊙鲜龋空間分離的GGA 2和AP-1分別調(diào)節(jié)Frizzled 6和Vangl 2的分選≈薷遥空間相關(guān)的貨物銜接子GGA 2和epsinR共同調(diào)控Frizzled 6的分選。
在本研究中牙饲,研究者主要借助STORM超分辨率顯微鏡來研究高爾基體網(wǎng)絡(luò)和內(nèi)體蛋白質(zhì)分選可視化摆采,目前在國內(nèi),隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM已成功實(shí)現(xiàn)商用舀鼎,有需要STORM成像技術(shù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究的專家老師們选从,可預(yù)約獲得 iSTORM 超高分辨率顯微成像系統(tǒng)試拍服務(wù)~
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