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什么是隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM浴誉?它有什么應(yīng)用吭敢?

發(fā)布日期: 2022-12-16

隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(stochastic optical reconstruction microscopy,簡(jiǎn)稱STORM)盈厘,是一種超分辨率顯微鏡逼庞,其分辨率比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上当盘。

我們知道你辣,光學(xué)顯微鏡憑借其非接觸立轧、無(wú)損傷等優(yōu)點(diǎn),長(zhǎng)期以來(lái)是生物醫(yī)學(xué)研究的重要工具。但由于光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率钓猬,傳統(tǒng)的顯微鏡已經(jīng)不適于生命科學(xué)研究中的超微結(jié)構(gòu)成像了稍刀。本文將從原理、應(yīng)用等方面對(duì)隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM進(jìn)行相關(guān)研究草悦,若表述不正確或者不到位赔绒,請(qǐng)各位老師指正。

01光的衍射限制了光學(xué)顯微鏡的分辨率

在了解STORM之前蝠兽,需要先知悉一個(gè)概念衡孽。眾所周知,光學(xué)顯微鏡是用可見光來(lái)觀察生物樣品的警综。而光是一種橫波谨寂,當(dāng)它經(jīng)過(guò)一個(gè)圓孔,且這個(gè)圓孔的大小與光的波長(zhǎng)差別不大時(shí)呵寂,光在此時(shí)不會(huì)沿直線傳播脆携,而是在各個(gè)方向上“溜走”。 光在傳播過(guò)程中豌魏,遇到障礙物或小孔時(shí)瞭核,光將偏離直線傳播的路徑而繞到障礙物后面?zhèn)鞑サ默F(xiàn)象,這就叫 光的衍射 唉私。

由此而形成的圓孔衍射圖樣绎蒙,叫“艾里斑”(圖1)。正因如此匪傍,任何一種顯微鏡系統(tǒng)都無(wú)法把光線在像平面匯聚成無(wú)限小的點(diǎn)您市,而是只能形成有限大小的艾里斑。如果兩個(gè)點(diǎn)很接近役衡,像平面上的兩個(gè)艾里斑就幾乎重合在一起茵休,那物平面上的兩個(gè)點(diǎn)就不可分辨了。

圖1手蝎、“艾里斑”概念圖

所以榕莺,光的衍射使得光學(xué)顯微鏡的分辨率存在著極限(約為200 nm),使得傳統(tǒng)顯微鏡無(wú)法清晰觀察尺寸在200 nm以內(nèi)的生物結(jié)構(gòu),極大制約了生命科學(xué)研究的發(fā)展棵介。

02超分辨率顯微鏡打破分辨率極限

科研工作者為了看到更精細(xì)的生命體精細(xì)結(jié)構(gòu)钉鸯,就要想辦法突破這一成像障礙。為此邮辽,多種超分辨率顯微鏡被開發(fā)了出來(lái)(超越了光學(xué)顯微鏡的分辨率極限唠雕,故被稱為超分辨顯微鏡)。 在這里吨述,我們集中討論其中這樣一個(gè)具有相對(duì)優(yōu)勢(shì)的顯微鏡: 隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM 岩睁。

在2006年的Nature上钞脂,莊小威與其它同事發(fā)現(xiàn)了一種能夠數(shù)百次反復(fù)在各種顏色的光照下使用且可在熒光態(tài)和暗態(tài)轉(zhuǎn)化的發(fā)光分子團(tuán),從而得到了一種比傳統(tǒng)光學(xué)顯微鏡高10倍以上分辨率的顯微技術(shù)湖生,并將其命名為隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡狡煎,簡(jiǎn)稱STORM。

03隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM技術(shù)原理簡(jiǎn)介

正如前面提到的那樣澳敞,兩個(gè)挨得很近的光點(diǎn)會(huì)讓我們分辨不出誰(shuí)是誰(shuí)瞧纹,那么如果我們分開來(lái)看呢?

也就是說(shuō)宴宠,當(dāng)我們照射并觀察第一個(gè)點(diǎn)時(shí)澳券,第二個(gè)點(diǎn)并不會(huì)發(fā)光,自然不會(huì)產(chǎn)生艾里斑影響我們觀察第一個(gè)點(diǎn)仲蔼,前者艾里斑的中心點(diǎn)位置就是熒光分子的準(zhǔn)確位置晾充。 接下來(lái),通過(guò)某種方法些搅,讓第二個(gè)點(diǎn)被照亮。這個(gè)時(shí)候第一個(gè)點(diǎn)又不在光斑的照明范圍之內(nèi)了赛邢,同樣不會(huì)干擾對(duì)第二個(gè)點(diǎn)的觀察乏呐。通過(guò)這種“以時(shí)間換空間”的設(shè)計(jì),巧妙地繞開了阿貝極限(顯微鏡分辨極限)的束縛剥悟,將光學(xué)顯微鏡的分辨率大大提高灵寺。

STORM技術(shù)就運(yùn)用了這種思想,它使用的是有機(jī)熒光分子對(duì)染料区岗,并且通過(guò)一些方法使細(xì)胞內(nèi)的一小部分熒光分子發(fā)光略板,而不是全部。這樣由于發(fā)光的點(diǎn)分布比較分散慈缔,重疊比較少叮称,因此每個(gè)光暈可以近似為一個(gè)熒光分子。在一次激發(fā)中藐鹤,可以確定一部分光暈的中心瓤檐,在下一次激發(fā)中,可以確定另外一部分光暈的中心娱节,把這許多次激發(fā)的結(jié)果疊加挠蛉,就是完整而清晰的圖像。

STROM成像過(guò)程包含一系列圖像循環(huán)肄满。每個(gè)循環(huán)中谴古,只打開視野下一部分熒光基團(tuán),這樣每個(gè)活躍的熒光集團(tuán)都被分辨拭兢,它們的圖像與其他分子分開少镇,不重疊胯炊。這樣確定了基團(tuán)的準(zhǔn)確位置,多次重復(fù)這個(gè)過(guò)程嫉簿,每次隨機(jī)打開熒光基團(tuán)的不同亞基抬而,得到圖像,確定每個(gè)亞基的位置后封鹦,把以上圖像重建成清晰的整個(gè)圖像墓老。 理論上STORM可得到分辨率達(dá)到幾個(gè)納米的熒光圖像。

04隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡STORM技術(shù)應(yīng)用案例

隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(STORM)是一種超分辨率顯微技術(shù)晾游,能夠在二維或三維辽蚀、多種顏色下成像,甚至可以對(duì)活細(xì)胞成像丽信。這種成像技術(shù)的方法根據(jù)正在成像的內(nèi)容泳落、如何成像以及正在產(chǎn)生的圖像類型而變化很大,可以應(yīng)用于生命科學(xué)的許多領(lǐng)域物忠,并為從神經(jīng)科學(xué)到亞細(xì)胞科學(xué)的許多不同需求提供非常高分辨率的圖像婚被。自STORM技術(shù)被提起以來(lái),越來(lái)越多的研究人員認(rèn)識(shí)到了這項(xiàng)技術(shù)的優(yōu)勢(shì)并廣泛運(yùn)用于研究中梳虽。

(以近些年的部分研究成果為例)

2013年址芯,cell 雜志上的一篇研究報(bào)告:莊小威團(tuán)隊(duì)利用超分辨率熒光成像方法(STORM)對(duì)端粒 DNA 進(jìn)行原位成像,直接可視化染色質(zhì)中的 T 環(huán)結(jié)構(gòu)窜觉,并系統(tǒng)地評(píng)估保護(hù)蛋白在 T 環(huán)形成中的作用谷炸。

圖3、STORM 成像顯示染色質(zhì)擴(kuò)散后的 T 環(huán)

2017年禀挫,Liu Riyue團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種光漂白的方法旬陡,以有效地降低藍(lán)藻和植物細(xì)胞的自身熒光并利用STORM技術(shù)在球形藍(lán)藻原綠球菌和開花植物擬南芥中獲得了~10nm的橫向分辨率。

圖4语婴、雙Z環(huán)的STORM圖像

2018年描孟,Lin, Danying團(tuán)隊(duì)提出了一種在固定樣本上采用Refresh熒光探針的方法,擴(kuò)展了多層 3D STORM的成像深度腻格,并顯示了COS-7 細(xì)胞中微管画拾、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道、擴(kuò)展深度 3D prSTORM圖像菜职。

圖5摊矮、 COS-7 細(xì)胞中微管、線粒體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的三通道睬漩、擴(kuò)展深度 3D prSTORM 圖像

2019影偶,Schlegel J , Peters S , Doose S 團(tuán)隊(duì)通過(guò)直接隨機(jī)光學(xué)重建顯微鏡(dSTORM)進(jìn)行超分辨率顯微鏡觀察,顯示腦膜炎球菌周圍有GM1聚集漫诬,突出了其對(duì)細(xì)菌侵襲的重要意義确羹。

圖6届审、表達(dá)GFP的腦膜炎球菌(綠色)的GM1和Gb3的dSTORM圖像

2021,Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak團(tuán)隊(duì)運(yùn)用STORM技術(shù)發(fā)現(xiàn)癣偶,表達(dá)IFT融合蛋白的細(xì)胞在纖毛基部噪旭,IFT亞基位于九個(gè)不同的位點(diǎn),在它們進(jìn)入纖毛干之前恃楔,IFT蛋白以高親和力凸该铮靠在纖毛基部的9個(gè)位點(diǎn)。

圖7涡写、IFT顆粒蛋白的定位菩擦,N-或C-末端3HA標(biāo)記的IFT蛋白、KIN1/KIF3A驅(qū)動(dòng)蛋白和銜接蛋白ODA16的頂視圖和側(cè)(側(cè))視圖的STORM圖像搅窿。

2021嘁酿,Blandin, Anne-Florence團(tuán)隊(duì)利用球狀體膠質(zhì)瘤細(xì)胞擴(kuò)散的體外模型,發(fā)現(xiàn)α5整合素缺失的細(xì)胞比表達(dá)α5的細(xì)胞對(duì)TKIs更敏感男应。

圖8闹司、吉非替尼處理的細(xì)胞的雙色dSTORM圖像顯示細(xì)胞外周和核內(nèi)體上的EGFR/β1整合素復(fù)合體

STORM因?yàn)槠鋬?yōu)異的單分子成像能力,越來(lái)越多的被用在細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu)的探索沐飘。對(duì)STORM的更多研究將提供更有效的方法來(lái)制備樣品和成像樣品开仰,以及提供更高分辨率的圖像。相信在未來(lái)這項(xiàng)技術(shù)能得到進(jìn)一步發(fā)展薪铜,變成功能更為強(qiáng)大的利器。

05超高分辨顯微成像系統(tǒng)iSTORM

現(xiàn)已發(fā)布的超高分辨率顯微成像系統(tǒng) iSTORM恩溅,成功實(shí)現(xiàn)了光學(xué)顯微鏡對(duì)衍射極限的突破隔箍,使得在 20 nm的分辨率尺度上從事生物大分子的單分子定位與計(jì)數(shù)亞細(xì)胞及超分子結(jié)構(gòu)解析脚乡、生物大分子生物動(dòng)力學(xué)等的研究成為現(xiàn)實(shí)蜒滩,從而給生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域帶來(lái)重大突破 奶稠。

超高分辨率顯微成像系統(tǒng) iSTORM 具有 20 nm超高分辨率绍掂、3通道同時(shí)成像、3D同步拍攝钟唯、實(shí)時(shí)重構(gòu)识俄、2小時(shí)新手掌握 等特點(diǎn),已實(shí)現(xiàn)活細(xì)胞單分子定位與計(jì)數(shù)焚痰,并提供熒光染料選擇纫蝗、樣本制備、成像服務(wù)與實(shí)驗(yàn)方案整體解決方案盯萄, 以納米級(jí)觀測(cè)精度仇韩、高穩(wěn)定性睁衰、廣泛環(huán)境適用、快速成像塌纯、簡(jiǎn)易操作等優(yōu)異特性蝴趾,獲得了高度認(rèn)可。

參考文獻(xiàn):

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2愿味、Doksani Y, Wu JY, de Lange T, Zhuang X. Super-resolution fluorescence imaging of telomeres reveals TRF2-dependent T-loop formation. Cell. 2013 Oct 10;155(2):345-356. doi: 10.1016/j.cell.2013.09.048. PMID: 24120135; PMCID: PMC4062873.

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4肘习、Lin, Danying, et al. "Extended-depth 3D super-resolution imaging using Probe-Refresh STORM." Biophysical journal 114.8 (2018): 1980-1987.

5际乘、Schlegel J , Peters S , Doose S , et al. Super-Resolution Microscopy Reveals Local Accumulation of Plasma Membrane Gangliosides at Neisseria meningitidis Invasion Sites[J]. Frontiers in Cell and Developmental Biology, 2019, 7.

6、Hazime, K.S., Zhou, Z., Joachimiak, E. et al. STORM imaging reveals the spatial arrangement of transition zone components and IFT particles at the ciliary base in Tetrahymena. Sci Rep 11, 7899 (2021).

7漂佩、Blandin, Anne-Florence, et al. "Gefitinib induces EGFR and α5β1 integrin co-endocytosis in glioblastoma cells." Cellular and Molecular Life Sciences 78.6 (2021): 2949-2962.

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